药学专业硕士设置四个方向：

药物合成新方法与新技术 主要包括：01药物生产工艺研究；02手性药物合成技术研究；03基于活性天然产物的创新药物研究；04药物绿色合成新工艺研究。特色与优势：具有一批由四川省千人计划专家、资深教授与高端外专为核心，优秀青年博士为骨干，药物工艺开发人员为支撑的师资队伍。拥有不同管线药物品种的合成关键方法和核心技术，尤其在抗生素研发及工艺研究领域达到国内外领先水平。

制剂工艺开发及药品质量控制 主要包括：01抗生素、心脑血管药物、抗肿瘤药物的脂质体和亚微乳注射剂研究；02肿瘤靶向药物转运载体研发；03药品质量控制及再评价研究。特色与优势：紧跟国际药物制剂及给药系统的发展前沿，与行业生产实际紧密联系，建立了成熟的缓控释制剂、药物脂质体等新型递药系统研究平台，基于天然产物活性成分建立药品质量标准。

微生物药物开发及药效评价 主要包括：01药用微生物资源及其活性次级代谢产物研究；02规模化生产工艺研究；03抗感染药物的药效评价、安全性评价以及药代动力学研究。特色与优势：拥有工业微生物菌种保藏中心、P2抗感染实验室、实验动物中心等。以成果转化为导向，以药用微生物资源及其药用价值的深度挖掘为主线，建立高效、规模化发酵技术。

临床药学 主要包括：开展药学服务工作，针对临床安全、有效、合理及经济用药开展个体化用药相关理论基础及应用研究。特色与优势：拥有三级甲等医院，重点研究药物防病治病的有效性、安全性与合理性，直接面向临床医疗第一线，为临床医师提供与医疗直接有关的药学方面的建议指导与技术服务，提高临床用药质量。