基础医学院始建于1956年，拥有基础医学博士后科研流动站、基础医学一级学科博士点、生物学一级学科硕士点，建立了“本科-硕士-博士-博士后”完整的培养体系。基础医学为重庆市首批一流学科和重点学科，生物学为重庆市重点学科。学院的神经科学与认知行为科学、生物学与生物化学、分子生物学与遗传学以及免疫学4个学科为ESI全球排名前1%的学科。

学院现有专职教师189人，教授58人（博导27人)，副教授83人，73.5%的教师具有博士学位﹔拥有全国优秀教师、教育部“新世纪优秀人才支持计划”人员、国家教育部首批骨干教师、重庆市名师等高层次人才20余名，多名教授在国内外担任重要学术要职；拥有国家级基础医学实验教学示范中心、国家级虚拟仿真实验教学中心、国家卫生部病理远程会诊试点省级中心、重庆市重点实验室，重庆市刑事侦查技术工程研究中心；学院承办的基础医学和法医学2个本科专业为国家级一流本科专业建设点，拥有国家一流课程2门，市级一流和精品课程16门，其综合实力已进入全国基础医学先进行列。

学院每年招收博士、硕士研究生120余名，并招收基础医学、法医学、生物信息学和医学实验技术专业本科生。与国内外10余所院校和科研院所建立了稳定的合作关系和师资培养协议。

基础医学专业

【学制】 五年

【学位授予】  医学学士

培养在医学院校和医学科研机构、临床有关实验室等部门从事基础医学各学科教学、科学研究及应用开发工作的高素质专业人才。

就业方向包括高等医药院校、医学科学研究机构、基础医学教育和科研工作；临床检验实验室、临床病理实验室、医院病理科、医疗企业技术岗位等。就业率90%以上，考研升学率近三年均在50%以上。

                           法医学专业

【学制】 五年

【学位授予】  医学学士

    培养具备医学基本理论知识、系统的法医学理论及基本技能，熟悉司法鉴定程序，具备创新精神、创业意识、实践创新能力，依托重庆市刑事技术工程中心、重庆法医验伤所、重庆市法医重点实验室，注重理论与实践紧密结合，能够从事法医学教学、科研、鉴定及相关工作的高素质复合型法医学专业人才。

就业方向包括公安局、检察院、法院的法医工作；医院医务、司法鉴定机构、保险理赔、法医教学与研究等。本专业近三年就业率90%以上，其中考上公务员比率25%以上，考研升学率达到30%以上。

                          生物信息学专业

【学制】 四年

【学位授予】  理学学士

    培养生命科学研究与国家生物技术相关产业发展需要，具备生物学和信息学基本知识和技能，在生物信息获取、处理、开发与应用等方面具有突出能力，能在科研机构、高等学校、医疗医药、环境保护等相关部门与行业从事教学、科研、管理、疾病分子诊断、药物设计、生物软件开发、环境微生物监测等工作的科学技术人才。

就业去向包括科研机构、高等医药院校、医疗医药、科技公司、环保等部门。近三年就业率为90%以上，考研升学率在30%以上。

                          医学实验技术专业

【学制】 四年

【学位授予】  理学学士

    培养适应生命科学和医学实验研究快速发展需求，具备基础医学、临床医学、医学实验技术等基本理论知识、技能和技术，系统掌握医学分子诊断、检测及科研领域的实验技术及相关仪器使用、管理维护，具有创新能力、一专多能的应用型专业人才。

就业方向包括医药院校、科研院所、医院病理科、血液中心、疾病预防控制中心、卫生检疫、生物技术公司、制药公司以及独立医学机构等实验室从事医学实验、医学研究和教学辅助工作。近三年就业率为90%以上，考研升学率均在50%以上，已就业毕业生均在医疗单位。