医学技术学院是在国家级重点中专重庆市药剂学校临床医学检验和卫生检验与检疫技术专业之上发展而来，至今已有近70年的办学历史。凭借严谨治学的育人态度、不断创新的育人方法，已向北京、上海、广州、重庆、四川乃至西部地区输送了数万名优秀毕业生。
      从2006 年重庆医药高等专科学校成立以来，学院进入了全新的发展阶段。经过央财能力提升建设（2011-2013），省级示范校专业群建设（2011-2014）、骨干专业建设（2016-2018）、优质校专业群建设（2018-2020）和双基地建设（2018-2020），现拥有5个教研室和40余间专业实训室，建有医学检验中心、职业卫生检验中心，眼健康管理中心，分子生物学研究室、病原微生物实训室（II 级）以及校内的大学生创业孵化园各1个。学院拥有先进教学设备价值1800 余万元，校外实训基地92个，主要培养医学检验技术、卫生检验与检疫技术、食品营养与检测、眼视光技术和医学营养专业的专科学生。
      学院在校学生近1900人；现有教职员工54人，其中专任教师41人（医检36人），硕士以上教师68%，高级教师55%，双师素质教师近95%。各专业行业兼职教师共计51人。团队为重庆市优秀教学团队，团队中有全国高职高专教育研究会医学检验学会常务委员、全国食品营养与检测专业教学指导委员会委员、卫生部卫生检验员资格考试中心专家库成员；重庆市卫生检验学会副主任委员、重庆市微生物学会常务理事、重庆市营养学会常务理事、重庆市检验专委会委员、重庆市生物化学及分子生物学学会理事。形成了学历层次高、专业水平高，以优秀教学团队和专业带头人为推动力，专兼结合的高职高专特色师资队伍。近三年来，团队获得国家专利或著作权71项，其中发明专利6项；主副编国家级教材30余部；已承担省级以上科研和教改课题38项，横向课题6项，在各类专业期刊上公开发表论文100余篇，其中核心期刊以上含SCI等论文40余篇；牵头主持国家食品营养与检测专业教学资源库1项，医学检验技术专业市级资源库1项，获批市级精品（在线开放）课程3门。团队荣获食药行指委云课堂竞赛一等奖、全国食品工业行指委信息化教学能力竞赛三等奖，省级信息化教学竞赛二、三等奖、微课竞赛二等奖、优秀网络课程和教学设计二等奖等多项奖项。
      学院鼓励教师积极教研教改，自主研发了5个虚拟实训平台（虚拟检验科、虚拟营养科、虚拟采样系统、半自动生化分析仪）、1 个实验教学信息管理平台和形态学教学和评价系统，并应用于日常教学和竞赛中，极大地促进了学生专业实践技能的培养。上述系列成果，也分别经过了全国卫生行指委医学技术类专委会主任胡野教授、山东医高专副校长张纪云教授、重庆医科大学陈婷梅教授及重医附一院、市人民医院等行业专家的鉴定。平台的使用，提高了学生的适岗能力，缩短了学生的试岗时间，培养的学生深受用人单位好评。
      学院历来注重紧贴行业需求，校企合作共同培养人才，服务区域发展。与四川迈克生物股份有限公司共同组建“迈克学院”，开展订单培养，连续6届，已培养了近200名高素质技术技能型人才；与重庆市美陆视光学眼镜有限公司合作设立大学生创业孵化园，由学生每日课余自主经营，工学交替强化技能实践，该园盈利全部用于本校眼视光学生创业支出和学生工作补贴。学院奖助学金和创业基金列全校之首，实现了专业的全覆盖，近100万元/年。学院与重庆迪安、重庆宝岛、重庆爱成、浙江诺特等单位相继开展了订单培养人才，随着校企合作不断深化深入，校企生三方受益格局凸显并形成良性循环。