生物信息学院成立于2000年，围绕健康信息领域开展科学研究、人才培养和“产学研用”地方经济服务。具备医疗仪器、医学信息工程、生物信息领域的本科生和研究生培养能力。所培养人才遍布在科研院所、数字医疗仪器企业、医药卫生机构，具备极高的美誉度和影响力。以健康信息为特色的生物医学工程学科在重庆和西部影响力巨大，在国内具有较高的知名度。
依托“互联网+”、大数据、“健康中国2030规划”等重大国家战略，面向智慧医疗、健康信息等产业的高速发展，秉承“创新驱动、精英培养”的理念，以“信息技术+专业”为人才培养优势，以科技创新素质养成为特色，培养信息技术在医疗装备、健康信息、生物大数据等领域中应用的高级专门人才。学院有极具特色的科研班训练计划和众创空间，鼓励学生参与创新创业及各类科技竞赛，近年来获中国“互联网+”大学生创新创业大赛等奖励国家级40余项、省部级100余项。
学院拥有生物医学工程和生物学硕士授权点，同时在兄弟学院联合招收培养信息类学科研究生，与美国乔治·华盛顿大学合作开展3+2模式数据科学专业（MS in Data Science）硕士研究生培养项目。
学院现有教师53人，专任教师43人。正高级职称14人，副高级17人，博士34人。兼职教授2名。博士/硕士研究生导师32人，省（部）级人才6人，人才队伍国际化和区域影响力居学校第一。北京大学原校长许智宏院士、乔治·华盛顿大学曾辰教授等一批著名专家为学院特聘或外聘教授。
学院建有重庆市医用电子与信息技术工程研究中心、重庆市数字医疗装备与系统工程实验室、大数据生物智能重庆市重点实验室，与兄弟学院共建重庆市唯一的智慧医疗系统与核心技术创新团队。获得6次中央与地方共建实验室建设项目，拥有2500多万元教学科研仪器。近年来主持和承担了科研项目100多项，发表科研论文600余篇，出版学术专著7部，获得国家专利40多项，国家级奖励1项，省部级奖励5项。
学院高度重视对外交流，与北京大学、清华大学、中国军事科学院、陆军军医大学，美国马里兰大学、乔治·华盛顿大学、EBI、Nicholls州立大学、华大基因、重庆西山科技等单位在健康信息领域进行深度科技交流与合作。
学院地处鸟语花香，悠远厚重的南部校区；全院师生努力拼搏，奋力建设一流的医用电子与生物信息学科；形成了“健康、和谐、朝气”的学院文化氛围。
083100生物医学工程
本学科主要包括生物医学信息学、生物医学仪器、系统生物医学、生物医学材料等研究方向：
(1) 生物医学信息学：主要包括生物医学信号处理、生物医学大数据、生物医学图像处理等内容。利用信息科学的理论、技术与手段，获取、分析、处理、挖掘、传输和综合利用医学和生物学数据、信息和知识，并对生命活动规律进行研究。
(2) 生物医学仪器：主要开展医用电子学研究。围绕临床医学应用和其他生命科学研究需求，特别是在人类疾病的预防、诊断、治疗、监护和康复上，提供新方法、新技术、研制新仪器，重点发展远程医疗相关仪器和可穿戴式设备。
(3) 系统生物医学：主要包括基因组学与蛋白组学、生物系统建模与仿真等内容。整合应用高通量组学技术以及疾病理论建模等现代生物信息技术，以个性化诊疗为目标，应用系统方法，探索建立疾病发生、发展的机理和预防及治疗的全新理论体系。
(4) 生物医学材料：主要包括医用材料的理论设计和性能研究等内容。通过研究医用材料的组成、结构及性能与生物体之间的相互作用，研究具有良好生物相容性和功能适配性的生物医学材料。
本学科的主要学位与专业课程有：现代医学信号处理、高级生物化学、分子生物学、生物信息学、计算分子生物学导论、智能控制理论与技术、嵌入式系统接口设计与应用、现代医学图像处理、数字医学仪器的设计与应用、医学信息系统、脑机接口研究、体域网、分子细胞生物学、基因组学与蛋白质组学、生物信息学算法、深度学习与人工智能、物联网导论、生物医学工程前沿技术等。
071000生物学
本学科主要包括生物信息学与计算生物学、生物化学与分子生物学、生物物理学等研究方向：
(1)生物信息学与计算生物学：在生物大数据存储、传输与处理方面进行了大量研究，建立了具有自主知识产权的蛋白质组学大数据平台iProX，为国家生物大数据的积累、共享和保护积累了经验。取得了一些标志性成果，发表在Nature Biotechnology等知名期刊上。目前研究的内容和特色：1）生物大数据整合、存储与传输；2）多组学数据的整合分析与挖掘；3）深度学习与复杂疾病分子机制。
(2) 生物化学与分子生物学：以生物大分子结构与功能及其相互关系为中心，利用理化及信息科学的方法，在分子水平上研究生命现象和生命过程的活动规律及人类复杂疾病的分子机制。目前在磷脂代谢关键酶的结构与功能、microRNA的鉴定及功能、生物催化等领域取得重要进展。目前研究的内容和特色：1）磷脂代谢酶的结构和功能；2）转录组和RNA功能；3）生物催化与生物转化。
(3) 生物物理学：微观上研究生物分子聚集体的结构、相互作用及其生物学性质在功能过程中的动态变化；宏观上研究光、电、磁等物理信号对复杂生物体系的影响。目前在半经典电子-辐射-离子动力学方法和光诱导反应机理等领域取得重要进展，研究的内容和特色：1）分子生物物理与多尺度计算；2）生物传感器与智慧医疗；3）环境信息感测与生物效应。
本学科的主要学位与专业课程有：高级生物统计学、高级生物化学、分子生物学、生物信息学、生物物理学、结构生物学、计算分子生物学导论、遗传学、现代医学图像处理、神经生物学、脑机接口研究、分子细胞生物学、基因组学与蛋白质组学、生物信息学算法、大数据分析与处理、机器学习、深度学习与人工智能、生物学前沿技术等。
