农业硕士植物保护领域主要依托植物保护一级学科，于2015年开始招生。目前拥有植物病理学、农业昆虫及害虫防治、农药学、农业环境保护等4个二级学科。重点围绕病虫害防治和绿色农药研发等关键技术领域，凝聚形成了农业有害生物综合防控、植物检验检疫与生物安全、生物药肥协同应用、蜜蜂产业体系、绿色农药创制与应用等研究方向。本学位点现有专任教师42人，先后有15人次荣获国家万人计划科技创业领军人才、中原基础研究领军人才、中原科技创新领军人才、中原青年拔尖人才、河南省政府特殊津贴专家、河南省高层次人才、河南省学术技术带头人、河南省高校科技创新人才等荣誉称号。另有河南省“黄大年式教师团队”1个，全国科技系统抗击新冠肺炎疫情先进个人1人，河南省优秀硕士生指导教师1人，河南省研究生教育管理工作优秀个人1人。建有农业农村部农药研制与施药技术重点实验室河南科技学院研发中心、国家蜂产业技术体系新乡综合试验站、河南省植物保护实验教学示范中心、河南省昆虫分类与系统演化国际联合实验室、河南省生物药肥研发与协同应用工程研究中心、河南省绿色农药创制与智能化农残传感监测工程技术研究中心等多个省部级教学科研平台。另建设有1个蜂产品中试基地及15个校外教学实践基地，从而为本学位点教学、科研、人才培养提供了有力支撑。学位点近5年来承担各级各类项目100余项，其中国家级项目15项，经费总额2000余万元。