机械工程系创办于1958年，2003年6月组建为机械工程及自动化学院。经过半个多世纪的艰苦创业和发展创新，机械工程及自动化学院在学科建设、师资队伍、教学改革与人才培养、科学研究与服务地方经济建设、对外合作与交流等各方面取得了显著成绩。“装备设计制造关键技术及先进材料”列入国家“211工程”三期建设项目，机械设计及理论学科被列为中央地方共建重点学科。目前学院拥有机械工程福建省特色重点学科；拥有机械工程一级学科博士点、博士后科研流动站，机械制造及其自动化、机械设计及理论、机械电子工程、车辆工程和材料加工工程等5个二级学科博士点；机械工程和力学两个一级学科硕士点，机械设计及理论等10个二级学科硕士点；机械工程和车辆工程2个专业学位硕士点；机械设计制造及其自动化、车辆工程和材料成型及控制工程等3个本科专业；拥有国家级机电工程实践教学示范中心、国家级装备设计制造实验教学示范中心和福州大学-厦工“国家级工程实践教育中心”等3个国家级实验实践教学示范中心；“机械设计制造及其自动化”和“车辆工程”2个国家级特色专业建设点。

学院下设机械设计系、机电工程系、材料成型系、车辆工程系和实践教学部等5个基层单位；学院拥有福建省高端装备制造协同创新中心、福建省制造业数字化设计工程研究中心、福建省工业机器人基础部件技术重大研发平台、福建省船舶海洋工程装备结构性能联合创新实验室、福建省高端装备制造业技术开发基地、海洋工程装备设计制造福建省高校工程研究中心、福建省CAD技术咨询服务中心和福建汽车联合研究所等8个省科研机构。

学院现有教职工130名，专任教师100名。其中教授25人，副教授47人，教师中具有高级职称人员占72%，具有博士学位专任教师70人，具有海外教育经历专任教师30人，45岁以下的青年教师68人。在职教师中拥有享受国务院政府特殊津贴专家4人；福建省百千万人才4人；福建省高校教学名师4人；福建省高层次创新创业人才1人；福建省“闽江学者特聘（讲座）教授” 6人；宝钢教育优秀教师奖6人；霍英东教育基金高等学校青年教师奖2人； “旗山学者”奖励计划2人。

学院一贯坚持教育以质量为本，继承与创新并重。在学校组织的历次校内教学评估，学院均名列前三名。获国家教学成果二等奖2项、福建省教学成果特等奖、一等奖、二等奖共11项。拥有省级教学团队3个，省级精品课程6门；出版专著和教材30多部。

“十二五”以来，学院承担国家863计划项目、国家自然科学基金、教育部基金、福建省重大科技资助项目、福建省自然科学基金重点项目等省部级以上项目150多项，企业横向项目100多项；共发表各类论文1200多篇。在国际著名学术期刊发表论文40多篇，在机械工程学报等国内著名期刊发表论文200多篇，被SCI、EI收录300多篇次。先后获福建省科学技术奖一等奖2项、二等奖8项、三等奖7项，福建省优秀自然科学论文一等奖2项、二等奖7项、国家质量监督检验检疫总局三等奖1项。获发明专利60多项，成果转让40多项。

近年来，对外学术交流广泛开展，邀请国内外知名专家80多人次作进行学术报告和学术交流，大大开阔了学术视野，有力地促进了教师学术水平的提高。学院教师受邀出访学者20多人次。教师参加国内和国际学术会议150余人次，并多次承办国际、国内学术会议。另外作为省级学会挂靠单位，还承担了福建省力学学会、福建省工程图学会、福建省铸造学会、福建省流体传动与控制学会和福建省刀具技术协会的日常运行工作。

学院紧紧围绕学校走区域特色创业强校之路的办学理念，建设具有较强学科相对优势的高水平“211工程大学”，体现研究教学型办学特色和开放式办学格局东南强校的总体战略目标，确立了以一流学科建设为目标，以内涵建设为重点,以提高质量为核心,全面提高人才培养质量、提升科学研究水平，增强社会服务能力的 “十三五”的建设发展规划。面向一流大学和一流学科建设的新机遇，全院教职工将继续发扬老一辈福大人艰苦奋斗、勇于拼搏的优良传统，抓住机遇，奋起新一轮创业，使我院不断地上档次、上规模、上水平，为我国和福建省地方经济建设、社会发展和科技进步做出更大贡献。