福州大学数学与计算机科学学院的前身为福州大学数学力学系，成立于1958年福州大学创建之初。1962年改名数学系。1977年设置应用数学、计算数学、计算机软件、计算机技术专业。1984年成立计算机科学与技术系。2003年6月，为坚持理工结合的办学特色，促进基础学科和应用学科互动发展，两系合并成立了数学与计算机科学学院。五十多年来，学院为国家和地区输送了大量专业人才，涌现了以中国科学院软件研究所林惠民院士等为代表的一批国内外知名的学者。

学院重视学科建设并取得了明显的成效。目前，数学学科是福建省特色重点学科，计算机科学与技术是福建省重点学科。现有1个数学学科博士后流动站，1个计算机科学与技术一级学科博士点，1个应用数学二级学科博士点，数学、计算机科学与技术、统计学和软件工程4个一级学科硕士点，数学与应用数学、信息与计算科学、计算机科学与技术、网络工程、信息安全、软件工程等六个本科专业，以及软件工程、计算机技术两个工程硕士点；计算机科学与技术是省级特色专业；学院离散数学学科是福州大学“211工程”三期重点建设学科，计算机应用技术学科也是福州大学“211工程”二期和三期重点建设学科方向。学院所涵盖的数学和计算机两大学科经过长期的积累，已经形成了多个有特色、有优势的学术研究方向，在理论研究和应用技术研究方面都取得了突出的成果。

学院现有离散数学及其应用教育部重点实验室、福建省网络计算与智能信息处理重点实验室、网络系统信息安全福建省高校重点实验室、与清华大学智能技术与系统国家重点实验室联合建立的认知系统与信息处理联合实验室、福建省超级计算中心以及多个校级研究机构作为学科平台。

学院坚持面向经济建设主战场，科研成果丰硕。近五年来，学院承担各类科技项目260余项，科研经费总量超过4000万元；承担了国家“973计划”课题2项，“863”项目子课题1项，承担国家自然基金资助项目51项，其中包括国家自然科学基金重点项目2项；承担省部级项目和横向课题超过120项。在科技成果方面，获4项省部级科学技术奖，专利授权11件。

学院拥有一支实力较强的师资队伍。在209名专任教师、专职科研人员中有教授41人、副教授86人，博士生导师12名，国家杰出青年基金获得者1人，入选国家青年千人计划1人，福建省“百人计划”入选者3人，省教学名师2人，闽江学者特聘教授5人，入选省“百千万人才工程”人选4人，福建省杰出青年基金获得者3人，入选省高等学校新世纪优秀人才10人，入选省高校杰出青年科研人才培育计划（自然科学类）4人。学院现任党委书记庄晨忠副研究员，院长常安教授。