福建医科大学药学院于2000年4月开设药学本科教育，是一个具有全日制与成人教育等多种办学形式，学士－硕士－博士等多种人才培养层次，已形成具有一定规模和影响，集教学、科研、开发与社会服务为一体的高等药学教育机构。设有药理学系、临床药学系、药物分析学系、药物化学系、药剂学系、天然药物学系、基础化学系、生物工程与生物制药学系8个学系，拥有2个省级药学实验教学示范中心；拥有肿瘤免疫与药物国家地方联合工程研究中心；拥有福建省生物医药工程研究中心、福建省新药安全性评价中心、福建省中药药理重点研究室、福建省天然药物药理学重点实验室、福建省高校天然药物药理学重点实验室和福建医科大学纳米医药技术实验室等6个省级研究机构，拥有新药研究所、临床药理研究所、蛇毒研究所和免疫治疗研究所等4个校级新药研究机构。

师资力量药学院现有教职员工108人，其中教授及正高级职称22人，副教授及副高级职称24人，博士生导师9人，硕士生导师40人，教师中具有博士学位者45名。师资队伍中享受国务院特殊津贴专家3人，福建省首批海西产业人才高地领军人才1人，福建省科技创新领军人才3人，福建省高校教学名师2人，福建省青年拔尖创新人才1项，引进福建省百人计划高层次人才2人，入选福建省“百千万人才工程”4人，教育部新世纪优秀人才支持计划1人，福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划4人，福建省高校杰出青年科研人才培育计划2人，福建省高校杰出青年科研人才培育计划2人。药学院教授担任了中国药理学会理事、中国药理学会肿瘤药理专业委员会副主任委员、教育部药学教育指导委员会委员、中国药理学会神经精神药理专业委员会委员等重要学术职务。

专业特色专业特色现设有药学、药物制剂、临床药学、生物制药和药物分析5个本科专业，拥有1个药学国家级特色专业（药学专业），1个省级综合改革试点专业（药学专业），1个省高校重点学科（药理学），1个省高校特色重点学科（药学），1支省级教学团队（药理学教学团队），5门省级精品课程（《药理学》、《药物分析》、《分析化学》、《卫生化学》和《药物化学》），1个省级创新实验区（“应用型”药学人才培养模式创新实验区），1个省级研究生教育创新基地（药理学），2个省级校外实践教学基地（福建省药品检验所、福州海王福药制药有限公司），2个省级教学实验示范中心（药学专业技能实验教学示范中心、药学实验教学示范中心），药理学博士学位授权点、药学一级学科硕士学位授权点和药学硕士专业学位授权点。获得省级教学成果奖一等奖1项（以学科建设促进药学人才培养的综合改革与实践），国家级大学生创新创业项目16项，省级大学生创新创业项目42项。药学院根据专业科学发展和人才市场的需要，注重培养学生动手能力及实践操作能力，全面提高学生综合素质和择业就业的抗风险能力，近年来，药学院本科生就业率达96.5%以上。

实验室建设近年来，学院以福建省重点高校建设为契机，加强对实验室建设的投入，购置了较为先进的教学科研仪器设备，较好地改善了教学科研条件，现学院实验室面积近14000 平方米，配备有高效液相-质谱联用仪、气相色谱-质谱联用仪、高速逆流色谱仪、流式细胞仪、高效液相色谱仪、多功能酶标仪、ArrayScan高内涵分析系统、红外光谱等大型贵重仪器设备，仪器设备总价值近4412万元，形成了一个集药物化学、药理学、临床前评价为一体的开放式、综合性、现代化的新药研究创新平台。

科学研究与成果近5年来，已获国家自然科学基金项目资助30项，资助经费1089万元；近5年共获得各类科研基金资助114项，省部级项目92项，共获项目经费2200多万元（含横向课题经费），其中获得“国家技术发展研究计划（863计划）”2项，“重大新药创制”科技重大专项1项，省科技重大专项1项。药学院在新药研发方面已形成了明显的特色和优势，重点构建了生物药物（抗体药物）研究、抗肿瘤药物研究、神经精神药物研究、纳米生物传感器研究、纳米生物医药材料研究等稳定的研究方向，获得具有开发前景的药用活性物质30多个，其中雷公藤内酯醇、钩吻素子有望开发成为国家1类新药。近5年来，获得省科技进步二等奖3项，三等奖4项，省运盛青年科技2项，福建省第二届6.18发明竞赛一等奖1项，国家专利授权40项；累计发表科研论文300余篇，SCI源期刊收录论文160余篇。