合肥工业大学研究生教育始于1960年，1978年恢复招生，1986年开始招收博士研究生，经过多年的积累和发展，逐步形成了层次完整、类型多样的研究生培养体系。

学校现有16个博士学位授权一级学科、2个博士专业学位授权点；38个硕士学位授权一级学科、19种专业学位授予权；现有（联合）国家重点实验室（培育）和国家工程实验室各1个、教育部重点实验室1个、教育部工程研究中心5个、国家地方联合工程研究中心3个、国家地方联合工程实验室和国家国际科技合作基地各1个。

学校坚持依靠教师办学，大力实施“人才强校”战略，现有专任教师2100余人，拥有中国工程院院士、中组部“万人计划”各类人才（含领军人才、教学名师、青年拔尖人才）、教育部“长江学者”特聘教授（含青年学者）、国家杰出青年科学基金获得者（含优秀青年科学基金）、国家“百千万人才工程”、教育部“新世纪优秀人才支持计划”等各类高层次人才100余人。

学校目前具有硕士、博士研究生13000余人。在研究生教育方面，学校主动适应我国研究生改革与发展的新形势，贯彻“育人为本”的方针，坚持以导师队伍建设为核心，以提高培养质量为关键，通过大力实施“研究生培养质量工程”，不断完善培养体系，规范培养环节，改革培养模式，着力培养研究生的科研创新能力和工程实践能力，保证研究生培养规模与质量的协调发展。