动物学依托畜牧和兽医学科，所在学科为浙江省一流学科。主要围绕我国地方品种畜禽种质资源创新与优质基因挖掘，动物消化道微生物区系调控与健康评价，重大动物疫病的病原功能基因组学，重大动物疫病和人兽共患病的病原检测等方面开展研究。在动物肠道微生物区系调控、浙东白鹅遗传繁育、单增李斯特菌、禽传染性法氏囊病、对虾白斑病等方面的基础研究具有自己特色和亮点。主要设置三个研究和招生方向：

（1）动物生态营养学

本方向主要聚焦动物的肠道健康，利用基因组学、蛋白质组学、代谢组学等方法研究营养物质的消化吸收机制、动物消化道微生物区系调控与健康评价，动物营养与养殖环境的关系，研发新型安全高效饲料添加剂和生物饲料，研发动物生态安全养殖技术。

（2）动物发育及免疫生物学

本方向主要聚焦动物的生长发育过程，通过调控动物生长和遗传繁殖过程，开发优良种质资源；通过动物免疫调控的研究，揭示免疫调控与动物生长的关系，开发提高动物免疫力的新技术。

（3）动物疾病防控

本方向主要研究重大动物疫病和人兽共患病的发病机制，开发动物疾病检测新方法，研发动物疾病防控新技术，开发伴侣动物的疾病治疗技术。