南昌大学药学专业于2000年7月开始招生，2002年12月成立原江西医学院药学系，2012年9月更名为南昌大学药学院。学院下设7个教研室、1个药学实验中心、1个新药研发中心实验室。建有3个省级重点实验室（江西省基础药理学重点实验室、江西省临床药物代谢动力学重点实验室及江西省药物靶点与新药筛选重点实验室），1个省级研究生教育创新基地，2个校级研究所。拥有药学一级学科博士学位授权点、药学一级学科硕士学位授权点、药学专业学位授权点。

学院现有药学及临床药学两个本科专业。现有全日制本科生682人，研究生179人。学院与中科院上海药物所、中科院庐山植物园、美国波士顿大学医学院及美国佐治亚大学药学院等多家单位在人才培养方面展开合作，已形成以本科生教育为基础、研究生教育和科学研究为重点的办学格局。

学院现有教职工65人，其中专任教师48人。有教授19人，副教授14人，具有博士学位者31人，博士生导师11人，硕士生导师30人，平均年龄40岁，具有海外经历者14人。学院现有“全国优秀科技工作者”称号1人和江西省“赣鄱英才555工程”人选2人，江西省百千万工程人选4人，江西省主要学科学术技术带头人1人，江西省高校中青年学科带头人6人。学院9名教师入选南昌大学“215人才工程”，其中5名教师入选赣江特聘教授，4名入选赣江青年学者。

药学一级学科为江西省“十二五”重点学科，药理学为江西省“十一五”重点学科，《药理学》课程为江西省精品资源共享课程及南昌大学校级精品在线开放课程，《药用植物学》、《生药学》为南昌大学优秀网络示范课程。

学院科研实力较强。近五年来，承担各级纵向课题100余项，其中国家级项目54项（包括“973计划”重大项目1项、国家“重大新药创制”科技专项3项，国家自然科学基金50项），到帐的科研经费总计近4000万元；在SCI、EI、ISTP等收录的期刊发表学术论文100余篇，在国家自然科学核心期刊发表论文100余篇，获国家发明专利30余项；获国家科技进步二等奖1项，省级科技成果奖励5项。