环境科学与工程学院创建于2015年4月，由原生命科学学院的环境科学教研室和化学化工学院环境工程教研室组建而成。学院现有2个本科专业：环境科学专业（2000年开始招生）、环境工程专业（2003年开始招生），在读本科生609余人；1个硕士点：环境科学（1997年开始招生），在读研究生6人。建有环境科学研究所、环境工程研究所和实验教学示范中心，拥有一支思想素质高、业务能力强、科研实力雄厚的师资队伍，现有专兼职教师45人，其中高级专业技术职务20人，获博士学位教师28人，具有环境科学与工程学科教授（研究员）职务任职资格学科评议权。

环境科学和环境工程专业是四川省本科人才培养基地，均被纳入省级卓越工程师教育培养计划（川教函[2012]200号和川教函[2013]750号），环境科学专业为省级特色专业（2010年），环境工程专业为四川省首批应用型示范专业（川教函[2017]33号 ） 。学院建有化学合成与污染控制四川省重点实验室（与化学化工学院共建）、大气灰霾监测超级站（与南充市环境保护局共建）、环境监测中心和环境教育与科普基地等科研平台，9个专业实验室（环境化学、环境微生物、环境生态、环境监测、环境影响评价、大气污染防治、水污染防治、土壤污染防治、环境工程仿真），配备了ICP-MS、高分辨质谱仪、气相色谱仪、高效液相色谱仪、TOC分析仪、离子色谱分析仪（IC）、原子荧光光谱仪、傅里叶红外光谱仪等价值近3000万元的教学科研设备，其中80%为新近原装进口设备。

学院建有南充市环境监测中心站、南充市垃圾焚烧发电厂、南充市污水处理厂、广安市环境监测中心站、遂宁市船山区环境保护局、广元市环境监测中心站、巴中市环境监测中心站、达州市环境监测中心站、四川科盛新环境科技有限公司和重庆天星环保工程有限公司等28个校外教学科研实践基地，覆盖南充、广安、遂宁、广元、巴中、达州、成都、重庆8个城市，涵盖环境监测、污水处理、垃圾焚烧、环保工程、环保科技等领域，2015年获四川省大学生校外实践教育基地（川教函[2015]191号）。为了丰富学生的第二课堂，更好地宣传环保，学院建有自贡市西湖幼儿园、自贡市华英实验学校、自贡市旭川中学、南充市莲池幼儿园、南充五中、南充十中、成都市永兴小学、成都市崇州中学附中、成都市青龙湖小学等18个环境教育与科普基地，2016年获四川省中小学环境教育社会实践基地（川环发[2016]5号）。（2017年6月更新）