医学信息学系成立于2008年，前身是现代教育中心，下设信息系统教研室，计算机应用教研室，计算数学教研室，生物医学工程教研室，医学信息实验中心5个部门。现有教职工28人，教授2人，副教授10人。高级职称占43%。其中，专职教师16人，兼职教师3人，1名企业工程师。具有博士学历的专职教师占16%，另有2名教师博士在读。在各级各类学会担任委员、理事2人。

近五年，医学信息学系教师主持省级教研项目12项，作为第一作者发表高质量教研论文23篇，以第一人身份获得厅局级以上教研成果3项，以主编、副主编身份参与编写教材8部。2017-2021年，教师指导学生发表学术论文6篇，获批省级以上大学生创新创业项目36项，获得省级以上大创竞赛奖项72项，学生作为第一发明人申请发明专利1项，参与发明专利2项。此外，还与东北林业大学邱兆文教授团队开展合作，跨校组建大学生创新创业团队，学生作为法人注册信息技术公司两家，依托国家级创业实践项目注册的信息技术公司1家，该公司已实现盈利。2009年至今，医学信息学系组织大型数学建模讲座10余场，共获得省级以上数学建模奖项68项，其中，国际奖项4项，国家级奖项6项，省级以上奖励100余项，约350名学生获得省级以上数学建模大赛奖项。近五年，医学信息学系教师获得各级各类奖项30余项，包括：大庆市劳动模范、大庆市五一巾帼标兵、哈尔滨医科大学青年五四奖章、哈尔滨医科大学优秀共产党员等奖项。医学信息学系坚持校企合作办学，教学内容保持与企业需求相符，常年聘请企业工程师进校授课，开展企业项目实训。毕业生实习前定期开展实习前实战训练。

学院科研团队从事癌症、心血管病等复杂疾病的生物信息学与系统生物学领域的研究。通过结合大数据分析、精准医学、机器学习、人工智能等技术方法，进行复杂疾病的生物分子网络与通路的模型构建、数据库和软件平台开发、数据挖掘、分析方法研究。团队形成了稳建的“教授-博士-研究生-本科生”的人才培养模式。近5年，全院教师获批各级别科研项目20余项，其中包含4项国家级项目和多项省级、厅局级与校级项目。目前全院师生累计发表SCI学术论文70余篇。尤其，多项研究成果论文发表在英国牛津大学出版社出版的《Nucleic Acids Research》、《Briefing in bioinformatics》、《Bioinformatics》等国际顶级专业杂志上。特别在转录调控领域的研究独具一格，成果达到国际先进水平。目前已经构建了世界上最全面的人类的超级增强子生物信息资源库SEdb和超级增强子领域第一款基于web平台的在线超级增强子上下游调控网络分析工具SEanalysis以及多个相关资源库，被美国、英国、德国等几十个国家的研究机构广泛使用。

医学信息学现有学生796人，17个班级，学生党员37人。一直秉承以人为本，立德树人的理念，全方位多角度提升学生的综合素养，培养众多高素质、高思想、高水平的创新型复合人才。院系通过开展第二课堂活动、优秀学子宣讲、读书分享、简历大赛、职业生涯规划大赛以及英语竞赛等一系列学生活动，夯实了学生的政治理论基础，强化了学生的专业技能水平。

同时依托信息专业特色引导学生参加各种专业技能和创新创业大赛，2021年度获省级以上62项，其中双创比赛共获奖24项，营销模拟类比赛共获奖2项，数学建模类比赛共获奖36项提升了学生实践和创新能力，从而提升了学生的就业能力。以实习带动就业，积极拓展实习基地，现有实习基地16家，与东软集团有限公司、杭州创业、联众智慧等著名的医疗软件公司合作，安排学生顶岗实习、带薪实习，近五年学生的就业率一直在学校名列前茅，在新的形势下，医学信息学系坚守“立德崇智以树人”的教育教学理念，不断开拓进取，努力前行，以新的姿态向新的目标迈进。