根据《广东药科大学2023版本科专业人才培养方案》，推进“前期大类，后期多元”的培养方式，大类招生专业于大一第2学期实施分专业分班，大二开始分流学习。分专业分班依据为：按学生第一个学期绩点(不含公选课)，由高到低排序，分别进入到相应专业学习。
生物工程
( 本专业为国家级创新人才培养实验区建设点 )
本专业培养掌握生物技术及其产业化的科学原理、工艺技术过程和工程设计等基础理论和基本技能，能在涉及生物技术与工程的“大健康”领域从事生产、开发及管理的创新型应用型工程技术人才。
基础课：高等数学、物理学、无机化学、有机化学、分析化学。物理化学、生物化学、生物统计学、人体解剖与生理学、生物信息学。
专业课：微生物学、植物生物学、细胞生物学、分子生物学、基因工程、发酵工程、生物分离工程、酶工程、细胞工程、工程制图、生物医学传感器、生物工程与大健康产业(案例)。
特色课：生物工程综合性实验、细胞工程综合性实验
生物制药
(本专业为国家一流本科专业建设点，国家级创新人才培养实验区建设点、教育部“战略性新兴产业相关特设本科专业”、广东省战略性新兴产业特色专业 )
本专业培养面向生物制药领域以及相关行业，掌握生物工程和生物制药等方面的基本理论、知识与技能，在生物制药工艺与质量控制方面有专长，并具备一定的创新能力和创业素质，能在企业、事业和行政管理部门从事与生物制药和生物工程有关的应用研究、技术开发、生产管理和行政管理等工作的创新性应用型高素质专门人才。
主要课程
生物化学、分子生物学、微生物学、细胞生物学、基因工程、发酵工程、生物分离工程、抗体工程、生物技术药物学、药剂学、生物药物分析、药理学、毒理学、生物技术药物研究与开发、生物工程综合性大实验、生物技术药物综合性大实验。
本科，基本学制四年，实行弹性学制。符合条件者，授予工学学士学位。