水利与土木工程学院前身是新疆八一农学院水利系，始建于1952年8月1日，1998年12月7日更名为水利与土木工程学院。

  学院师资队伍结构合理、实力雄厚，拥有包括中国工程院院士邓铭江教授等16名顶尖专家。有享受国务院政府特殊津贴专家5人，国家百千万人才工程1人，自治区教学名师2人，自治区教学能手3人，13人次入选自治区人才称号。

  学院现设有7个本科专业，其中水利水电工程专业入选国家第一批一流本科专业点;农业水利工程专业入选国家第二批一流本科专业点、国家第一批卓越农林人才教育培养计划改革试点项目;土木工程专业为一本招生专业，入选自治区一流本科专业点;以及智慧水利、水文与水资源工程、工程管理、水土保持与荒漠化防治等专业。《2019中国双一流学科建设评价报告》中，学院水利工程学科位全国前12%(并列排名第8)，属中国一流学科。

  学院拥有水利工程一级学科博士点及博士后科研流动站，土木工程一级学科硕士点，土木水利专业硕士点，负责农业工程博士点的农业水土工程方向，有9个国家和省部级科研平台。2001年以来，获国家科技进步二等奖3项，省部级科技进步一等奖18项。70年来，学院始终以“厚基础、宽口径、强能力”为目标，共培养了近万名享有较高声誉，深受社会好评的专业技术人才，60%以上毕业生成长为水利行业中层领导和骨干。目前在校本科生2400余人，硕士、博士研究生400人。