农学院前身为农学系，是1952年建校首批设立的系部之一。现设有农学、植物保护、种子科学与工程、智慧农业、动植物检疫(植物检疫方向)和生物育种技术等6个专业。学院获批教育部丝绸之路经济带作物生物育种国际合作联合实验室、农业农村部重点实验室、教育部棉花工程研究中心，自治区级重点实验室、协同创新中心、重点学科和作物学博士后科研流动站。拥有作物学一级学科博士学位授权点，作物学、植物保护学2个一级和7个二级学科硕士学位授权点，1个农业硕士学位授权点。学院党委先后荣获全国先进基层党组织和全国党建工作标杆院系。学院持续推进涉农专业订单定向人才培养计划，与自治区种业协会合作设立“种业订单班”。

  学院师资力量雄厚，现有教授、副教授32人，80%为归国留学人员。具有博士学位教师49人，博士生、硕士生导师58人。自治区教学名师3人、教学能手1人，39人次入选自治区级人才项目，5人获自治区优秀博士后，1人入选自治区优秀青年科技人才，10人入选自治区各类人才计划专项，2人获校级教学标兵。获全国高校微课大赛一等奖1项，三等奖1项。学院累计荣获国家级教学成果奖一等奖1项、三等奖1项;自治区级二等奖1项;校级一等奖2项、二等奖6项、三等奖3项。