动物科学学院前身是新疆八一农学院畜牧兽医系畜牧专业。学院设有动物科学专业、马业科学专业2个本科专业，动物科学专业入选国家级一流专业建设点，马业科学专业入选自治区级一流专业建设点。畜牧学为自治区优势学科，设立畜牧学博士后科研流动站。学院有畜牧学一级学科博士学位授权点，1个农业硕士学位授权点（畜牧），国家级实验教学示范中心1个，省部级科研平台5个，自治区级研究生产学研基地8个。学院获第六届全国杰出专业技术人才先进集体、自治区第八次民族团结进步模范集体、自治区巾帼建功先进集体、新疆青年五四奖章集体。学院师资力量雄厚，有教授、副教授26人，具有博士学位教师占91.89%，博士生导师12人，硕士生导师29人，有全国先进工作者2人，国务院特殊贡献专家称号3人，开发建设新疆奖章获得者3人，18人次在全国、自治区专业委员会担任理事以上职务，2人入选自治区级高层次人才，2入选自治区现代农业产业体系首席专家、5人入选岗位专家。