2016年，生物医学工程专业毕业生就业率名列前茅，就业质量高，平均薪酬位居学院前列，就业面广。

已毕业学生就业去向：广东各医疗器械生产企业、电子信息及计算机企业、中山大学孙逸仙纪念医院、中山大学肿瘤医院、广东武警总队医院、广东各地市级医院、广东省医疗器械质量监督检验所等。