药学系毕业生就业率连续多年位居前列，就业面广，就业质量高，已毕业学生分布于医院药学部、政府药品检验部门、药品研究机构、各级药品监督管理部门、药品生产企业、医药公司等企事业单位。从事医药工作3年以上者可报考执业药师。

毕业学生还可继续深造学习，攻读硕士学位，近三年我系考取研究生人数分别为3人、6人、8人， 录取院校包括中山大学、广东药科大学、广州中医药大学、澳大利亚昆士兰科技大学等国内外知名学府。