设有硕士学位授权一级学科点27个。
硕士学位授权一级学科点情况
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| 序号 | 一级学科名称 | 所属门类 | 单位名称 | 授权时间 |
| 1 | 作物学 | 农学 | 作物科学学院 | 1998年6月 |
| 2 | 植物保护 | 农学 | 植物保护学院 | 1998年6月 |
| 3 | 园艺学 | 农学 | 园艺学院 | 2006年1月 |
| 4 | 林学 | 农学 | 林学院 | 2006年1月 |
| 5 | 生物学 | 理学 | 生命科学学院 | 2006年1月 |
| 6 | 农林经济管理 | 管理学经 | 济学院（海峡乡村建设学院 | ）2006年1月 |
| 7 | 林业工程 | 工学 | 交通与土木工程学院 | 2006年1月 |
| 8 | 食品科学与工程 | 工学 | 食品科学学院 | 2006年1月 |
| 9 | 农业资源与环境 | 农学 | 资源与环境学院 | 2006年1月 |
| 10 | 畜牧学 | 工学 | 动物科学学院 | 2006年1月 |
| 11 | 农业工程 | 工学 | 机电工程学院 | 2006年1月 |
| 12 | 兽医学 | 农学 | 动物科学学院 | 2011年3月 |
| 13 | 机械工程 | 工学 | 机电工程学院 | 2011年3月 |
| 14 | 交通运输工程 | 工学 | 交通与土木工程学院 | 2011年3月 |
| 15 | 环境科学与工程 | 工学 | 资源与环境学院 | 2011年3月 |
| 16 | 应用经济学 | 经济学 | 计算机与信息学院 | 2011年3月 |
| 17 | 马克思主义理论 | 法学 | 马克思主义学院 | 2011年3月 |
| 18 | 工商管理 | 管理学 | 管理学院、旅游学院 | 2011年3月 |
| 19 | 公共管理 | 管理学 | 公共管理学院 | 2011年3月 |
| 20 | 生态学 | 理学 | 生命科学学院 | 2011年8月 |
| 21 | 风景园林学 | 工学 | 艺术学院、园林学院（合署） | 2011年8月 |
| 22 | 统计学 | 理学 | 计算机与信息学院 | 2011年8月 |
| 23 | 计算机科学与技术 | 工学 | 计算机与信息学院 | 2016年9月 |
| 24 | 化学工程与技术 | 工学 | 材料工程学院 | 2016年9月 |
| 25 | 水产 | 农学 | 动物科学学院 | 2016年9月 |
| 26 | 地理学 | 理学 | 林学院 | 2018年3月 |
| 27 | 设计学 | 艺术学 | 艺术学院、园林学院（合署） | 2018年3月 |
