旅游管理硕士（Master of Tourism Administration，简称MTA）是国家教育部2010年正式设立的专业硕士教育项目，旨在培养高层次应用型旅游专门人才，是与工商管理硕士(MBA)和公共管理硕士（MPA）同类型、同层次的教育项目。MTA以在职人员为招生对象，以培养旅游行业管理精英为目标，课程安排强调前沿性、实战性、创新性，是业界人士提升管理运作能力、丰富人脉网络、助推事业成功的重要平台。牡丹江师范学院是黑龙江省哈尔滨市外高校唯一开展MTA教学的单位，设有东北亚旅游经济研究、区域旅游资源开发与规划、旅游文化与旅游教育、酒店与景区管理四个研究方向，现面向全国招收全日制MTA研究生。该专业拥有一支专业化的导师团队，其中，教授8人、副教授11人、讲师2人；具有博士学位7人、硕士学位12人；具有相关职业资格证书的“双师型”教师占70.1%。除校内导师外，为每名学生配备一名校外实践型兼职导师，皆是来自旅游管理政府部门、酒店、景区等旅游行业的专家。该专业设有校级科研机构——“旅游规划研究院”，与牡丹江市文化广电和旅游局、镜泊湖旅游集团等政府机构和企事业单位紧密合作，开展与现代旅游产业相关的战略性、前瞻性和应用性研究，产业政策和行业发展的信息咨询、发展战略和规划研究，以及各类项目规划、景区开发、人才培养和信息咨询等科研服务，可以为学生提供丰富的实践锻炼空间。此外，该专业还拥有丰富的实践实训资源，建有包括如旅游规划实验室、3D导游模拟实训室、ERP实训室等设施完备、功能齐全的实训中心。同时，在北京、上海、深圳、牡丹江等地建有多个教学实习基地，能为旅游管理专业研究生培养提供充分的实践实习基地保障。2011年，该专业经教育部批准获得开展中外联合办学资质，与俄罗斯、韩国等国家数十所高校常年互派留学生，为旅游管理硕士专业学位研究生培养提供了良好的国际交流平台。