核能与核技术工程方向是国内为数不多的全日制专业学位硕士研究生培养专业，依托于“地学核技术”四川省重点实验室。专业侧重于为涉核企业和核电建设部门培养应用型、复合型高层次工程技术和管理人才。

该方向主要研究：核资源勘查工程、核技术工程、辐射防护与环境工程。核资源勘查，是面向全国地矿勘查等部门培养从事放射性地质调查、勘探的专门人才；核技术工程主要是面向核技术在核仪器仪表、核检测以及核安全方面的应用培养专门人才；辐射防护重点面向环境放射性监控、核医学等领域培养专门人才。采用全日制“2+1”学习方式，学习年限为3年。其中在校课程学习时间为1年，校外企业实践和毕业论文撰写为2年。该专业毕业生就业率100%。