自然地理学专业有生态环境与景观修复、土地利用与国土整治、旅游地学与国家公园、国土资源信息系统四个研究方向。本专业以自然资源为研究对象，以“3S”技术为研究手段，以生态环境保护为研究目标，致力于资源利用与环境保护的有机统一。其中，土地利用与国土整治、国土资源信息系统方向以西南地区空间景观格局变化、国土空间规划、土地资源节约集约利用为主要内容，培养学生在自然资源调查与评价、土地利用与覆被变化、区域景观格局变化等领域的研究能力，服务于我国西南土地资源开发利用、长江上游的社会经济发展，为国民经济协调健康发展提供支撑。生态环境与景观修复、旅游地学与国家公园方向侧重培养学生在区域和各生态功能区环境保护与评价、国家公园保护与利用、青藏高原生态环境演化等领域的研究能力，进而揭示人类活动与自然环境的相互作用和影响、气候变化对碳、氮、水循环的影响、全球变化的在西南地区的环境响应，为区域经济可持续发展和环境保护提供科学依据。