轨道交通学院为学校下设具有轨道交通行业特色的二级学院，办学地点为学校闵行校区。学院已开设教育部专业目录内城市轨道交通类全部六大专业，分别为城轨车辆、供电、机电、工程、通信信号、运营管理，其中城轨车辆专业为上海市一流专业、中高职贯通高水平专业、上海市首批职业教育产教融合型专业，城轨车辆专业群为上海市高水平专业群，常年为上海及长三角轨道交通行业输送高素质技能人才。学院建有城市轨道交通开放实训中心、虚拟仿真实训中心，与上海地铁维护保障有限公司共建产业学院，培养的学生在全国技能大赛、全国职业院校技能大赛等重大赛事中屡获佳绩，部分优秀学生获全国技术能手、上海市技术能手称号。学院历届毕业生就业率稳居97%以上，国企签约率超过65%。主要对口企业有上海地铁维护保障有限公司、中国铁路上海局集团有限公司、申通阿尔斯通（上海）轨道交通车辆有限公司、上海市域铁路运营有限公司、上海地铁运营有限公司、中铁第四勘察设计院集团有限公司等知名企业。