牡丹江医学院口腔医学院前身为牡丹江医学院口腔医学系，成立于2007年。经过几年的发展壮大，口腔医学院于2012年4月正式成立,并批准为一表专业招生。口腔医学院下设口腔医学院办公室、教研科和5个教研室即口腔基础教研室、口内、口外教研室、修复、正畸教研室及4个实验室即口腔修复实验室、口腔技能实验室、口腔组织病理实验室、口腔解剖生理实验室。

口腔医学院现有教师48人，其中专职教师32人，兼职教师16人。教授23人，副教授11人，博士12人，硕士11人。口腔医学院以口腔医学专业五年制本科教育为主，同时还承担本科医疗、麻醉、检验、影像专业口腔科学的教学任务。口腔医学专业是牡丹江医学院校级重点专业之一，现有1门题为“健康的口腔，灿烂的微笑”的省级精品视频公开课及2门校级精品共享课。依托于红旗医院优良的实习基地和师资队伍，坚持以教学为中心，以能力培养为重点，以人才质量为根本，以教书育人为目标，为社会培养具有德、智、体、美全面发展的、综合素质较高的，能够在口腔医疗机构中承担常见病、多发病诊治、修复和预防工作的应用型和创新型口腔医学专业人才。

口腔医学院拥有省内先进的教学及医疗设备，固定资产达到400多万元，为学生学习和全面培养创造良好的外部环境。口腔医学专业于2006年开始招生，招生生源十分充足，历届学生的考研率、就业率、执业医师一次性通过率都很高，据统计毕业生平均考研率为32%；一次性平均就业率为96.88%；职业医师平均通过率为88.5%。

口腔医学院将始终秉承以人为本的理念，坚持科学发展观，脚踏实地，锐意进取，团结协作，不断创新，逐步跻身口腔医学专业的先进行列，为牡丹江地区医疗卫生事业的发展起到积极推动作用，为口腔医学事业做出应有的贡献。