马克思主义学院于2018年1月正式成立，学院前身是1992年设立的马列主义教研室。马克思主义学院是学校从事思想政治理论课教学科研的专门机构，下设《习近平新时代中国特色社会主义思想概论》《思想道德与法治》《马克思主义基本原理》《中国近现代史纲要》《毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论》《形势与政策》六个思想政治理论课教研室以及思想政治教育专业教研室。

学院获批云南省“三全育人”综合改革试点学院，《思想道德与法治》获批云南省一流课程建设，《马克思主义基本原理》《习近平新时代中国特色社会主义思想概论》《毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论》为校级一流课程。思想政治教育专业为校级一流专业。根据教育教学工作需要，学院设置综合办公室、教学科研办公室、学务办公室。

马克思主义学院现有专职教师46人。其中，副高级以上职称15人；具有硕士以上学位46人，其中博士2人、在读博士1人；有学校骨干教师4人；“双师型”教师2人。学院聘请来自清华大学在内的10多名国内著名学者为客座教授。学院获批“云南省铸牢中华民族共同体意识研究基地”1个，“文山州教体局共建大中小思政课一体化学研修中心”1个，设有“老山精神与文化国防研究中心”、“西畴精神研究中心”2个校级研究平台。