商学院前身是成立于2001年的经济管理系，2005年改为现名，是安徽新华学院设立最早的二级学院之一，在校学生规模曾一度达到6500余人。2015年9月，财务管理、经济与金融等专业从商学院分离，成立财会与金融学院。目前商学院下设贸易经济、工商管理、物流工程等3个系。有国际经济与贸易、电子商务、市场营销、人力资源管理、物流管理、物流工程等6个本科专业和国际贸易实务、电子商务、商务管理、物流管理等4个专科专业。其中，物流管理专业获评为省级振兴计划重点建设专业、省级特色专业、电子商务专业获评为省级卓越人才培养计划实施专业、校级特色专业。

学院现有在校生2700余人，有专任教师78人，其中，具有高级职称的教师为17人，具有博士学位的教师为12人，具有硕士以上学位教师占94.9%。教师教学科研能力较强，近年来，专职教师中有3人获得省级“优秀教师”称号，1人获得省级“教坛新秀”称号。同时，培养校级教学名师1人、校级教坛新秀5人；获批校级教学团队2个、校级科研团队1个。专职教师主持承担厅级以上教科研项目23项，其中三类科研项目10项。

商学院建有物流实训中心、ERP实训中心、电子商务实验实训中心、国际贸易实验实训室、人力资源实验实训中心等5个实验实训中心。建有校内快递、华园电子商务等校内学生创业实训公司。与宝供物流、苏宁云商、华信智源等10家企业建立校外实践教学基地。其中，获批省级校企合作实践教育基地1个，校级示范实验实训中心2个、校级示范实践教学基地3个。

学院围绕高素质应用型专门人才培养，大力推进产学研合作教育，积极开展教育教学改革。与国家职业标准相衔接的物流管理专业课程体系建设取得显著成效；“以学生为主体”的教学方法和“以能力为导向”的考核方式改革取得阶段性成果；学生参加国家级、省级物流设计大赛、电子商务“三创”大赛多次获奖；电子商务创业人才培养取得明显成果，受到中国青年报、安徽商报等媒体的多次报道，省市发改委领导和多所兄弟院校同仁多次前来参观指导，创业学生典型被评为“合肥市十大经济人物”。近年来，商学院教师共主编应用型教材10余部，获省教学成果奖二等奖、三等奖各2项。

商学院在学校“立德、立业、立人”育人理念的指导下，一直坚持“商为国计，学为民生”的办院宗旨，着力培养社会责任感强、基础扎实、实践能力强，具有创新精神、职业素养和发展潜力的高素质应用型商务人才，十余年来培养毕业生近万人，就业率均超过96%，曾多次被学校评为就业先进集体。毕业生动手能力强，综合素质较高，普遍受到用人单位的好评。