生物工程领域的积淀自我校生物学、生态学、林产化学加工工程等学科成立开始，已有50年的历史，在此基础上逐步建设，于2011年获生物工程专业硕士学位授予权。现有1个国家工程实验室（南方林业生态应用技术国家工程实验室），2个国家级实验教学示范中心（森林植物国家实验教学示范中心、林业工程国家实验教学示范中心），2个省部级实验室（国家林业局生物乙醇研究中心、湖南省林业生物技术重点实验室）作为本学科支撑，实验室面积4200m2，设备总价值4600万元。本学位点建立了高质量的人才培养和产学研及科研创新基地，包括与“湖南省福来格生物技术有限公司”联合申报紧密合作获批的国家工程实验室（全国医药工业用酶研发和产业化基地），湖南省研究生培养创新基地（生物制品湖南省研究生培养创新基地），与株洲“千金药业”股份有限公司联合申报获批的湖南省高校产学研合作示范基地（亚热特色森林植物资源高效利用及产业化产学研示范基地），并在浏阳国家生物医药产业园建立了实践实习基地。经过多年的建设，形成了融科学研究、人才培养、专业教育和社会服务为一体的学科发展体系。

生物工程硕士专业学位是与工程领域任职资格相联系的专业性学位，侧重于工程应用。本专业培养目标为生物工程领域科学研究与开发应用、工程设计与实施、技术攻关与技术改造、新技术推广与应用、工程规划与管理等方面，能紧密联系生物工程领域的生产和研究开发涉及的技术与工程实际的高级工程技术人才。

我院生物工程领域的建设与企业需求紧密结合，走以创新为主导的发展道路，在生物医药、生态规划、生物转化、生物修复等方面的特色显著，基础牢固。近5年来，学科承担国家省部及企业合作项目30多项，发表SCI、EI收录论文20多篇，获省部科技成果奖3项，获国家发明专利10多项，为中南地区的生产企业提供了大量的技术支助，在国内具有一定的学术地位，为地区经济和环境保护的协调发展做出了突出的贡献。