物理学与电子信息工程系是以电子科学与技术为主干学科，以信息与通信工程、计算机科学与技术、机械电子工程和控制科学与工程等学科为依托，致力于电子工程、信息处理、光电材料与器件、机械电子等领域的技术问题研究和平台建设，逐步形成电子系统设计、信息处理技术、光电子技术及应用、机电控制及自动化、嵌入式应用、光机电技术、软件仿真技术等方向为支撑的，富有特色的教学内容体系。开办4个本科专业、在校生1100多人。设有大学物理、电工电子、电子工程、信息工程、光电子、近代物理和数字创意设计七个综合实验室和一个综合实训基地；实验室建筑面积达12000平方米，实验设备约3000万元。

电子系拥有一支素质优良的教师队伍，现有教授6人，副教授20人，讲师23人（其中具有博士学位教师14人, 硕士学位教师27人）。近3年来,申请到各类课题68项，其中承接国家自然科学基金、863项目6项,省部级项目12项，教育厅项目26项，与省内外企业合作的横向课题30多项；在国内外期刊上共发表论文约144篇，其中有52篇文章被SCI、EI等收录；申请各类专利17项；有3位教师在全国发明展览会上获银奖1项、铜奖2项。连续多年获闽江学院科研先进单位。

电子系已发展成为教学与实验设施省内先进,具有一定优势与特色的电子信息类专门技术人才培养基地。现已拥有1个福建省新建本科院校首批重点建设学科(电路与系统) 、1个省级工程研究中心(电子信息与控制工程中心)、1个省级创新团队（福建省电子信息专业人才培养创新实验区）、1个省级本科高校专业综合改革试点（电子信息工程）、2个省级重点建设的实验中心（电子实验中心和物理实验中心）和2项中央财政支持地方高校发展专项资金项目（ 数字创意设计实验室和高端装备光机电数字控制研究中心）。