马克思主义学院创立于2009年10月，2011年4月正式成为独立的、直属于学校领导的思想政治理论课教学科研二级机构。学院的主要职能是承担福州大学本科生、研究生的思想政治理论课教学和马克思主义理论学科研究与人才培养任务。

学院的发展定位：以福州大学本科生、硕士和博士研究生的多层次思想政治理论课课程教学与建设为基础，以发展研究生教育为重点；加强思想政治理论教学团队建设和马克思主义理论学科建设，形成教学和科研相互协调、互为支撑的发展模式。

学院现有专职教师40人，其中：教授5人，副教授10人，高级职称占教师比例38%；具有博士学位和在读博士学位的教师17人，占教师比例42.5%。

学院现有的教学与科研机构有：

5个教研部：

《马克思主义基本原理》教研部（简称“原理教研部” ）、《毛泽东思想与中国特色社会主义理论体系概论》教研部（简称“概论教研部” ）、《思想道德修养与法律基础》教研部（简称“基础教研部” ）、《中国近现代史纲要》教研部（简称“纲要教研部” ）和研究生思想政治理论公共课教研部。

1个马克思主义理论一级学科硕士点和1个科学技术哲学二级学科硕士点：

马克思主义理论一级学科硕士点获批于2010年，分设：马克思主义基本原理（2005年获批）、思想政治教育（2005年获批）、马克思主义发展史、马克思主义中国化研究、国外马克思主义研究、中国近现代史基本问题研究等6个二级学科研究方向；

科学技术哲学二级硕士点获批于2000年。

4个研究所：

科学技术与社会研究所（STS）

中国思想文化史研究所

青少年研究所

新经济与知识产权研究所

1个省级教师培训与研修基地：

福建省“思想道德修养与法律基础”课程教师培训和研修基地。