学院前身为内蒙古畜牧兽医学院畜牧系，1952年11月由河北农学院畜牧系、山西农学院兽医组和平原农学院畜牧兽医组组建而成。学院下设动物遗传育种与繁殖、动物营养与饲料科学、动物生产与管理、水产养殖学4个系。学院畜牧学科为自治区第一批双一流建设学科，学院有畜牧学博士后流动站1个、一级学科博士学位授权点1个，拥有农科教合作国家级人才创新培养基地1个，有二级学科博士学位授权点3个、二级学科硕士学位授权点3个、专业硕士授权点1个，有动物科学和水产养殖学2个本科专业（方向），其中动物科学专业分为蒙汉双语授课。动物科学专业是国家特色专业、自治区品牌专业。动物科学专业为教育部第一批卓越农林人才教育培养计划改革试点项目。动物遗传育种与繁殖学为国家重点（培育）学科，动物营养与饲料科学、动物遗传育种与繁殖学2个学科为自治区重点学科。《家畜育种学》为国家级精品课程和自治区级在线开放课程，动物遗传育种教学团队为国家级教学团队，动物遗传育种与繁殖学实验室为自治区重点实验室，动物营养与饲料实验室为自治区重点实验室（培育）。目前，学院承担着国际、国家、自治区科学研究及科技成果转化项目60余项，科研经费达4000余万元。

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