控制工程学院前身是电气与信息工程系，2018年更名为控制工程学院。学院下设“3系1部”，分别为自动化系、测控仪器系、轨道交通控制系和电工电子教研部。实践教学由3个实验教学分中心组成。学院拥有自动化、测控技术与仪器、轨道交通信号与控制3个本科专业以及工业过程自动化技术、电气自动化技术、电子信息工程3个专科专业。

  自动化专业2019年被评为自治区一流专业，测控技术与仪器2021年被评为自治区一流专业。轨道交通信号与控制本科专业为全疆高校唯一设置专业。电气控制与PLC实验教学分中心2018年获批新疆自治区实验教学与实践教育示范中心。

  控制工程学院现有教职员工73人，其中专职教师队伍55人，实验员6人，学生管理人员12人。教师队伍中博硕士学历教师占教师总人数的56%。学院教师以立德树人为根本任务，牢记为党育人、为国育才使命，扎根祖国边疆，教书育人。电工电子及轨道教师党支部荣获2022年度国家党建工作样板支部，2020年度自治区首批“双带头人”党支部书记工作室，2021年度首批党建工作样板支部。近年来，教师队伍中荣获“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛优秀指导教师2名，煤炭行业优秀教学团队(培育)1个，自治区教学名师1名，自治区教学能手3名，全国创新教育杰出贡献个人奖5名，自治区巾帼建功标兵1名，自治区优秀党务工作者1名，自治区师德先进个人1名，自治区民族团结先进个人1名，自治区政协委员1名。学院教师获全国煤炭行业教育教学成果奖二等奖1项，自治区教学成果二等奖2项，三等奖2项，校级教学成果一等奖2项，全国高校教师教学创新大赛新疆赛区二等奖，自治区精品课程1门，自治区一流课程2门。校级精品课程10门，获校级优秀教学奖励20多人次。学院教师负责的专业课程多媒体课件获得国家优秀奖5项和自治区一等奖1项，出版和自编教材18部。学院教师近5年获省部级科学技术奖励6项。

  学院面向丝绸之路经济带核心区、自治区“八大产业集群建设”对自动化类应用型人才的需求，注重产教融合、协同育人，培养高水平的应用型本科人才。学院现有在校学生1805人。历届本科生在全国大学生电子设计竞赛、“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛、中国机器人大赛、“西门子杯”中国智能制造挑战赛等竞赛中获得多项省部级以上奖励。应届毕业生就业率一直保持在90%以上。多年来，学院为新疆的煤炭、石化、电力、新能源、铁路、自动化等行业培养了一批基础扎实，具有较强实践能力和创新精神的高水平工程技术专业人才，为建设新疆的人才保障工作做出了重要贡献。