学校已经构建了以国际贸易学、金融学、产业经济学、企业管理、国际法学、外国语言学及应用语言学为主干学科，以区域经济学、应用统计学、世界经济、会计学、管理科学与工程、民商法学、统计学等为支撑的国际经贸学科群，涵盖了经、管、文、法、理五大学科。学校不断优化学科结构布局，按照“国际一流、国内顶尖、国家和上海急需”的标准，以高原学科建设为依托，对标一流学科建设，重点发展优势学科，重视有发展潜力、与学校发展目标高度相关的新兴学科，构成了相互融合、协调发展的学科体系，现有7个一级学科硕士点，33个二级学科硕士点，9个专业硕士学位点。
上海对外经贸大学省部级重点研究基地一览表
| 类别 | 基地名称 |
| 国家级实验教学示范中心 | 国际商务实验中心 |
| 国家级人才培养模式创新实验区 | 国际经济与贸易应用型专门人才培养模式创新基地 |
| 国家级本科大学生创业教育基地 | |
| 省部级重点实验室 | 国际商务实验中心 |
| 省部级研究基地 | 上海普通高等学校人文社会科学重点研究基地——国际经贸研究所 |
| 上海市社会科学创新研究基地、上海发展战略研究所王新奎工作室 | |
| 上海市社会科学创新研究基地、上海发展战略研究所黄建忠工作室 | |
| 上海高校知识服务平台——上海国际贸易中心战略研究院 | |
| 上海高校智库——国际经贸治理与改革开放联合研究中心 | |
| 上海市政府决策咨询研究基地——“高端开放与国际规则”决策咨询研究基地 | |
| 上海发展战略研究所孙海鸣工作室 | |
| 上海高校人文社会科学重要研究基地——数据科学与管理决策重点实验室 | |
| 商务部学术支撑基地 | 中国WTO贸易政策审议中心 |
| 2011协同创新中心 | 中国(上海)自由贸易试验区协同创新中心 |
| 世界贸易组织教席 | 教席主持人--张磊教授 |
上海市政府的“上海WTO事务咨询中心”，商务部和上海市政府共建的“全球贸易投资研究咨询中心”均设立在本校。
学校聚焦国家和上海的重大需求，不断提升综合研究创新能力，不断提升服务国家和上海经济社会发展、培养高质量人才、提供智库支撑的能力。以服务国家和上海对外经贸发展战略的应用性研究为科学研究主攻方向，在世界贸易组织和多边贸易体制、中国对外贸易政策等研究领域取得了一批重要的研究成果，为国家和上海经济社会的发展提供决策咨询。
作为中国（上海）自由贸易试验区协同创新中心协同高校和国家发改委“一带一路”协同高校，学校在自贸区建设和“一带一路”建设、自由贸易港等领域具备较强的研究能力。学校积极开展校内协同、校际协同、校外协同，相继成立中国“一带一路”经贸关系与合作研究院、“自由贸易港研究院”、国内首家“人工智能与变革管理研究院”等。
上海对外经贸大学省部级以上重点学科一览表
| 类别 | 名称 |
| 上海市高峰高原学科 | 应用经济学 |
| 工商管理 | |
| 上海市重点学科 | 应用经济学（上海市一流学科） |
| 国际贸易学（上海市重点学科） | |
| 上海市教委重点学科 | 产业经济学 |
| 金融学 | |
| 企业管理 | |
| 外国语言文学与应用语言学 | |
| 国际贸易法（国际法学） |
上海对外经贸大学学位点分布
| 一级学科硕士点(7个） | 应用经济学、理论经济学、工商管理、外国语言文学、法学、统计学、马克思主义理论 |
| 二级学科硕士点 (33个） | 国际贸易学、金融学、产业经济学、区域经济学、数量经济学、金融工程、会计学、企业管理、旅游管理、技术经济及管理、财务管理、审计学、市场营销、外国语言学及应用语言学、英国语言文学、日语语言文学、法语语言文学、国际法学、民商法学、经济法学、知识产权法、世界贸易组织法、马克思主义中国化研究、保险学、会展经济与管理、人力资源管理、商务信息管理、统计学、国民经济学、国际投资、国际经济、跨国供应链管理、诉讼法学 |
| 专业硕士学位点 (9个） | 工商管理、英语口译、英语笔译、法律硕士（法学）、法律硕士（非法学）、国际商务、会计硕士、金融硕士、统计硕士 |
